臺北市政府衛生局為因應昨(13)日發生中心綜合醫院疫苗批號登錄錯誤事件，故當(13)日主動請中央全面清查臺北市COVID-19疫苗合約醫療院所預防接種登錄資料，下午中央告知康寧醫院似有批號登錄錯誤情事，北市衛生局隨即派員稽查，於晚間確認該院並無使用過期疫苗，惟10月8日計有263筆接種紀錄批號錯誤登錄為K004C-CDC。為避免發生資料庫大量資料修改之異常狀況，北市衛生局10月14日函請中央協助確認並更正兩間醫院的異常接種紀錄，以維護民眾權益。
臺北市衛生局說明，該局9月27日撥配5瓶AZ疫苗(批號K004C-CDC)給康寧醫院，已於10月1日全數接種完畢。經衛生局比對該院藥庫疫苗進出貨紀錄及疫苗接種名冊，疫苗配貨量與消耗量資料相符。
康寧醫院10月8日施打AZ疫苗計263人，共有2個批號，分別為210159-CDC(效期1101130)施打242人，A1080-CDC(效期1110131)施打21人，合計施打263人，因該院電腦資訊系統未更新疫苗批號，接種紀錄以批次上傳至全國預防接種資訊系統(NIIS)，造成263人的疫苗接種紀錄均誤植為批號K004C-CDC，實際上並無存放及提供過期疫苗之情形。
衛生局已給予該院行政指導，接種疫苗前務必三讀五對，確認疫苗廠牌、劑量及效期，並檢核疫苗接種紀錄上傳正確性，除請康寧醫院及中心綜合醫院提交異常事件檢討報告，並要求醫院於疫苗批號修正後應逐一通知民眾以維護其權益。